A Simple Mixed-Effects Model to Smooth and Extrapolate Weights-at-Age for 3Ps Cod
A Simple Mixed-Effects Model to Smooth and Extrapolate Weights-at-Age for 3Ps Cod
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- dc.contributor.author
- Cadigan, N.
- dc.date.accessioned
- 2024-01-08T18:03:17Z
- dc.date.available
- 2024-01-08T18:03:17Z
- dc.date.issued
- 2023
- dc.description.abstract - en
- Good estimates of weight-at-age for fishery catches and the stock are necessary for more reliable stock assessment and projections. I use a simple model to filter out “noise” in the 3Ps cod weight-at-age estimates, and to fill in missing values, especially for older ages and the age 14+ group that will be used in assessment models for the stock. The weight model is applied to estimated weight-at-age from fishery monitoring activities and also weight-at-age from the Fisheries and Oceans Canada (DFO) Spring research vessel (RV) survey which are assumed to represent weight-at-age in the stock. The other important model inputs are information about the precision of sampling estimates of weight-at-age which the model uses to help distinguish between population variability and measurement error. The model fits the fishery weights-at-age closely for those ages with low measurement error coefficients of variation (CVs). The survey weights-at-age have more between-year variability and presumably higher CVs and therefore the model did not fit these data as well but did capture the overall trends in the weights-at-age over time.
- dc.description.abstract-fosrctranslation - fr
- De bonnes estimations du poids selon l’âge des prises de pêche et du stock sont nécessaires pour établir une évaluation et des projections plus fiables des stocks. J’utilise un modèle simple pour éliminer le « bruit » dans les estimations du poids de la morue selon l’âge dans la sous-section 3Ps et pour indiquer les valeurs manquantes, particulièrement pour les groupes d’individus plus âgés et pour le groupe des individus âgés de 14 ans et plus qui seront utilisés dans les modèles d’évaluation du stock. Le modèle de poids est appliqué au poids selon l’âge estimé obtenu par les activités de surveillance des pêches et au poids selon l’âge obtenu par les relevés de recherche menés par Pêches et Océans Canada (MPO) au printemps, qui sont censés représenter le poids selon l’âge dans le stock. Les autres intrants importants du modèle sont les renseignements sur la précision des estimations du poids selon l’âge, tirées des échantillonnages, que le modèle applique pour faciliter la distinction entre la variabilité de la population et l’erreur de mesure. Pour les âges où les coefficients de variation (CV) d’erreur de mesure sont faibles, le modèle ajuste les poids selon l’âge des individus pêchés. Les poids selon l’âge des relevés présentent une plus grande variabilité entre les années et probablement des CV plus élevés, de sorte que le modèle n’a pas été aussi bien adapté à ces données; il a quand même tenu compte des tendances générales des poids selon l’âge au fil du temps.
- dc.description.fosrcfull - en
- 1 online resource (iv, 49 pages) : charts
- dc.description.fosrcfull-fosrctranslation - fr
- 1 ressource en ligne (iv, 49 pages) : graphiques
- dc.identifier.citation
- Cadigan, N. 2023. A Simple Mixed-Effects Model to Smooth and Extrapolate Weights-at-Age for 3Ps Cod. DFO Can. Sci. Advis. Sec. Res. Doc. 2023/024. iv + 49 p.
- dc.identifier.govdoc
- Fs70-5/2023-024E-PDF
- dc.identifier.isbn
- 9780660479750
- dc.identifier.issn
- 1919-5044
- dc.identifier.uri
- https://waves-vagues.dfo-mpo.gc.ca/library-bibliotheque/41109259.pdf
- https://open-science.canada.ca/handle/123456789/1557
- dc.language.iso
- en
- dc.publisher
- Fisheries and Oceans Canada, Canadian Science Advisory Secretariat
- dc.relation.istranslationof
- https://open-science.canada.ca/handle/123456789/1558
- dc.subject - en
- Nature and environment
- Water
- dc.subject - fr
- Nature et environnement
- Eau
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- dc.title - en
- A Simple Mixed-Effects Model to Smooth and Extrapolate Weights-at-Age for 3Ps Cod
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- Report
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- Rapport
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- iv, 49 pages
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- 2023/024
- local.report.series
- Research Document (Canadian Science Advisory Secretariat)
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Name: SimpleMixedEffectsModelSmoothExtrapolateWeightsAge3PsCod-41109259.pdf
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