Development of a state space assessment model for Cod (Gadus morhua) in NAFO subdivision 3Ps
Development of a state space assessment model for Cod (Gadus morhua) in NAFO subdivision 3Ps
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- dc.contributor.author
- Champagnat, J.
- Vigneau, J.
- Varkey, D. A.
- Regular, P.
- Ings, D. W.
- Babyn, J.
- Morgan, J.
- dc.date.accessioned
- 2024-04-09T12:01:01Z
- dc.date.available
- 2024-04-09T12:01:01Z
- dc.date.issued
- 2024
- dc.description.abstract - en
- A state-space assessment model (SAM) that incorporates commercial catches and survey indices is developed for the 3Ps cod stock. It allows for process and observations errors and uses random walks in fishing mortality rate to estimate time variant selectivity. The model provides estimates of stock size, fishing mortality and recruitment together with their uncertainties and would eventually have the ability to provide stochastic forecasts. The objective of the study is to achieve an accurate estimation of the stock dynamics and better account for uncertainty. Four runs of the model are presented here with different options on mortality and survey inputs. Runs produce comparable estimation but lead to different stock status in the recent period. They also perform differently in terms of retrospective analysis, residual patterns, and description of latent processes. Three runs out of four produced outputs with concerning issues, so they could not be accepted as basis for assessment advice. The last one (called sentinel run) was kept as a “control model,” which means it would be use for comparison purpose alongside with the accepted model (i.e., state-space model [HYBRID]).
- dc.description.abstract-fosrctranslation - fr
- Un modèle d’évaluation À espace d’état (SAM) qui incorpore les captures commerciales et les indices des relevés est mis au point pour le stock de morue dans la sous-division 3Ps. Il tient compte des erreurs de processus et d’observation et utilise des marches aléatoires pour le taux de mortalité par pêche pour estimer une sélectivité variable dans le temps. Le modèle fournit des estimations de la taille du stock, de la mortalité par pêche et du recrutement, ainsi que les incertitudes associées, et au final pourrait fournir des prévisions stochastiques. L’objectif de l’étude est de parvenir à une estimation précise de la dynamique des stocks et de mieux prendre en compte l’incertitude. Quatre exécutions du modèle sont présentées ici avec différentes options qui ont traits à la mortalité et aux relevés utilisés comme données d’entrée. Les exécutions du modèle produisent une estimation comparable, mais conduisent à différents états du stock sur la période récente. En outre, elles montrent des résultats différents en ce qui concerne l’analyse rétrospective, les profils des résidus et la description des processus latents. Trois exécutions sur quatre ont produit des résultats problématiques, qui n’ont donc pas pu être acceptés pour établir les avis en matière d’évaluation. La dernière exécution (appelée exécution sentinelle – avec données sur la pêche sentinelle) a été conservée comme « modèle témoin », ce qui signifie qu’il serait utilisé à des fins de comparaison, avec le modèle accepté (c’est-à-dire le modèle à espace d’état [HYBRIDE]).
- dc.description.fosrcfull - en
- 1 online resource (iv, 98 pages) : maps, charts
- dc.description.fosrcfull-fosrctranslation - fr
- 1 ressource en ligne (iv, 98 pages) : cartes, graphiques
- dc.identifier.citation
- Champagnat, J., Vigneau, J., Varkey, D.A., Regular, P., Ings, D.W., Babyn, J., and Morgan, J. 2024. Development of a State Space Assessment Model for Cod (Gadus morhua) in NAFO Subdivision 3Ps. DFO Can. Sci. Advis. Sec. Res. Doc. 2024/015. iv + 98 p.
- dc.identifier.govdoc
- Fs70-5/2024-015E-PDF
- dc.identifier.isbn
- 9780660701462
- dc.identifier.issn
- 1919-5044
- dc.identifier.uri
- https://waves-vagues.dfo-mpo.gc.ca/library-bibliotheque/41234881.pdf
- https://open-science.canada.ca/handle/123456789/2247
- dc.language.iso
- en
- dc.publisher
- Fisheries and Oceans Canada, Canadian Science Advisory Secretariat
- dc.relation.istranslationof
- https://open-science.canada.ca/handle/123456789/2248
- dc.subject - en
- Nature and environment
- Water
- dc.subject - fr
- Nature et environnement
- Eau
- dc.subject.en - en
- Nature and environment
- Water
- dc.subject.fr - fr
- Nature et environnement
- Eau
- dc.title - en
- Development of a state space assessment model for Cod (Gadus morhua) in NAFO subdivision 3Ps
- dc.type - en
- Report
- dc.type - fr
- Rapport
- local.pagination
- iv, 98 pages
- local.report.reportnum
- 2024/015
- local.report.series
- Research Document (Canadian Science Advisory Secretariat)
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Name: DevelopmentStateSpaceAssessmentModelCodGadusMorhuaNAFOSubdivision3Ps-41234881.pdf
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