Un modèle état-espace pour l’évaluation du stock de morue (Gadus morhua) dans la sous-division 3Ps de l’OPANO
Un modèle état-espace pour l’évaluation du stock de morue (Gadus morhua) dans la sous-division 3Ps de l’OPANO
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- dc.contributor.author
- Varkey, D. A.
- Babyn, J.
- Regular, P.
- Ings, D. W.
- Kumar, R.
- Rogers, B.
- Champagnat, J.
- Morgan, M. J.
- dc.date.accessioned
- 2024-01-12T12:36:55Z
- dc.date.available
- 2024-01-12T12:36:55Z
- dc.date.issued
- 2022
- dc.description.abstract - fr
- Le présent document décrit l’élaboration d’un modèle état-espace (HYBRIDE) pour l’évaluation du stock de morue dans la sous-division 3Ps de l’Organisation des pêches de l’Atlantique Nord Ouest (OPANO). Le modèle HYBRIDE est ajusté au relevé de recherche du MPO (1983 à 2005, 2007 à 2019), ainsi qu’aux séries chronologiques des relevés supplémentaires suivants : le relevé ERHAPS (Évaluation des ressources halieutiques de la zone 3PS) de l’IFREMER (Institut Français de Recherche pour l’Exploitation de la Mer, anglais : French Research Institute for Exploitation of the Sea) (1978 à 1991), le relevé du Conseil des allocations aux entreprises d’exploitation du poisson de fond (GEAC) (1998 à 2005) et les relevés de pêche sentinelle au filet maillant et à la palangre (1995 à 2018). Le modèle HYBRIDE s’ajuste également aux données sur les pêches, en espérant que le modèle puisse séparer la mortalité par pêche de la mortalité naturelle. On ajuste les prises selon l’âge dans les pêches à l’aide de logits du rapport de continuité et les débarquements dans les pêches par une vraisemblance censurée. L’utilisation de la vraisemblance censurée pour ajuster les débarquements permet d’inclure l’opinion des experts sur la fiabilité des débarquements dans toute la série chronologique du modèle. Le modèle HYBRIDE présenté ici commence en 1959, qui est la première année pour laquelle des données sur les débarquements sont disponibles. Le modèle HYBRIDE permet d’explorer différentes formes de paramétrage de la sélectivité des pêches variable dans le temps, de la mortalité naturelle et des approches pour estimer les données sur les prises selon l’âge. Les formules du modèle diffèrent également en fonction des séries de relevés utilisées pour l’ajustement du modèle. Dix-sept formules sont présentées. D’autres formules fondées sur la mortalité par pêche sont incluses : 1. une sélectivité logistique platikurtique ou en forme de dôme avec des périodes temporelles; 2. une marche aléatoire de la normale multivariée du genre SAM (State-space Assessment Model, Nielsen et Berg 2014); 3. un processus séparable corrélé âge-année pour le taux de mortalité par pêche (F), similaire au modèle d’évaluation de la morue du Nord (Cadigan 2016); 4. la possibilité d’interrompre les processus pour F les années où des événements importants (comme un moratoire) ont eu un impact sur la pêche. D’autres formules fondées sur la mortalité naturelle sont incluses : 1. une mortalité naturelle invariable entre les âges et les années; 2. une mortalité naturelle variable dans le temps liée à la condition des poissons. Les différentes formules du modèle sont comparées et évaluées en fonction des valeurs du critère d’information d’Akaike (CIA) et de leur rendement dans les analyses rétrospectives. Les participants à la réunion ont conclu que la mortalité naturelle variable dans le temps est un élément important à prendre en compte pour modéliser la dynamique de la morue dans la sous division 3Ps et sélectionner un modèle de population pour ce stock. Après avoir évalué les autres formules du modèle, les participants ont considéré que la formule 11 du modèle, qui inclut l’ajustement aux séries de données des pêches sentinelles, dans laquelle F est modélisée à l’aide d’une marche aléatoire de la normale multivariée avec une pause d’un an pour le moratoire et dont le taux de mortalité naturelle (M) est variable dans le temps, est utile en tant que modèle d’évaluation du stock de morue dans la sous-division 3Ps.
- dc.description.abstract-fosrctranslation - en
- The paper describes the development of a state-space model (HYBRID) for the stock assessment of Northwest Atlantic Fisheries Organization (NAFO) Subdivision 3Ps cod stock. The HYBRID model fits to the DFO RV survey (1983–2005, 2007–19) as well as the following additional survey time series: the IFREMER (Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer, English: French Research Institute for Exploitation of the Sea) ERHAPS (Evaluation des Ressources Halieutiques de la région 3PS) survey (1978–91), the Groundfish Enterprise Allocation Committee (GEAC) survey (1998–2005), and the sentinel gillnet and line-trawl surveys (1995–2018). The HYBRID model also fits to fisheries data with the expectation that the model can separate fishing mortality from natural mortality. Fisheries catch-at-age is fit using continuation ratio logits, and the fisheries landings are fit via censored likelihood. The use of censored likelihood for fitting landings allows the inclusion of expert opinion on reliability of landings throughout the model time series. The HYBRID model presented here starts in 1959, which is the first year for which landings data are available. The HYBRID model allows exploration of different forms for parameterization of time-varying fisheries selectivity, natural mortality, and approaches for estimation of catch-at-age data. The model formulations also differ depending on the survey series used in fitting the model. Seventeen model formulations are presented. Alternate formulations based on fishing mortality included: 1. a logistic flat topped or dome selectivity with time-blocks 2. SAM (State-space Assessment Model, Nielsen and Berg, 2014) style Multivariate Normal random walk 3. a separable age-year correlated process for fishing mortality rate (F) similar to NCAM (Cadigan 2016), and 4. option to break the processes for F in years where important events (like a moratorium) have impacted the fishery. Alternate formulation based on natural mortality included: 1. invariant natural mortality across age and years, and 2. time-varying natural mortality related to fish condition. The different model formulations are compared and evaluated on the basis of AIC (Akaike Information Criterion) values and their performance in retrospective analyses. The meeting concluded that time-varying natural mortality is an important consideration for modelling the dynamics of 3Ps cod and selecting a population model for this stock. Following the evaluations of the alternate model formulations, model formulations 11 which includes fit to sentinel data series, has F modelled using an MVN Random walk with year break for the moratorium, and has time-varying natural mortality rate (M) was considered to have utility as an assessment model for 3Ps cod stock assessment.
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- Varkey, D.A., J. Babyn, P. Regular, D.W. Ings, R. Kumar, B. Rogers, J. Champagnat et M.J. Morgan. 2022. Un modèle état-espace pour l’évaluation du stock de morue (Gadus morhua) dans la sous-division 3Ps de l’OPANO. Secr. can. des avis sci. du MPO. Doc. de rech. 2022/022 vi + 81.
- dc.identifier.govdoc
- Fs70-5/2022-022F-PDF
- dc.identifier.isbn
- 9780660431079
- dc.identifier.issn
- 2292-4272
- dc.identifier.uri
- https://waves-vagues.dfo-mpo.gc.ca/library-bibliotheque/41058306.pdf
- https://open-science.canada.ca/handle/123456789/1726
- dc.language.iso
- fr
- dc.publisher
- Pêches et Océans Canada, Secrétariat canadien des avis scientifiques
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- https://open-science.canada.ca/handle/123456789/1725
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- Un modèle état-espace pour l’évaluation du stock de morue (Gadus morhua) dans la sous-division 3Ps de l’OPANO
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- Rapport
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- Document de recherche (Secrétariat canadien des avis scientifiques)
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