Surveillance des infections invasives à streptocoques du groupe A au Canada, 2020

Golden, Alyssa; Griffith, Averil; Demczuk, Walter; Tyrrell, Gregory; Kus, Julianne; McGeer, Allison; Domingo, Marc-Christian; Hoang, Linda; Minion, Jessica; Van Caeseele, Paul; Smadi, Hanan; Haldane, David; Zahariadis, George; Mead, Kristen; Steven, Laura; Strudwick, Lori; Li, Anita; Mulvey, Michael; Martin, Irene

doi:https://open-science.canada.ca/handle/123456789/615

Surveillance des infections invasives à streptocoques du groupe A au Canada, 2020

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creativework.keywords - fr: IISGA; Streptococcus pyogenes; Canada; emm; surveillance; résistance aux antimicrobiens; streptocoque du groupe A
dc.contributor.author: Golden, Alyssa; Griffith, Averil; Demczuk, Walter; Tyrrell, Gregory; Kus, Julianne; McGeer, Allison; Domingo, Marc-Christian; Hoang, Linda; Minion, Jessica; Van Caeseele, Paul; Smadi, Hanan; Haldane, David; Zahariadis, George; Mead, Kristen; Steven, Laura; Strudwick, Lori; Li, Anita; Mulvey, Michael; Martin, Irene
dc.date.accessioned: 2023-06-08T14:39:21Z
dc.date.available: 2023-06-08T14:39:21Z
dc.date.issued: 2022-09
dc.description.abstract - fr: Contexte : L’infection invasive à streptocoques du groupe A (IISGA) (causée par Streptococcus pyogenes) est une maladie à déclaration obligatoire au Canada depuis 2000. Cet article résume les données démographiques, les types emm et la résistance aux antimicrobiens des IISGA au Canada en 2020. Méthodes : Le Laboratoire national de microbiologie de l’Agence de la santé publique du Canada (Winnipeg, Manitoba) collabore avec les laboratoires de santé publique provinciaux et territoriaux pour assurer la surveillance nationale du S. pyogenes invasif. Le typage des gènes emm a été effectué sur tous les isolats en utilisant le protocole de séquençage du gène emm des Centres de contrôle et de prévention des maladies (Centers for Disease Control and Prevention). Les susceptibilités antimicrobiennes ont été déterminées par diffusion sur disque de Kirby-Bauer, conformément aux directives de la Clinical and Laboratory Standards Institute. Les taux d’incidence des IISGA basés sur la population jusqu’en 2019 ont été obtenus par le biais du Système canadien de surveillance des maladies à déclaration obligatoire. Résultats : Dans l’ensemble, l’incidence de l’IISGA au Canada est passée de 4,0 à 8,1 cas pour 100000 habitants entre 2009 et 2019. L’incidence de 2019 représente une légère baisse par rapport au taux de 2018, qui était de 8,6 cas pour 100000 habitants. Un total de 2867 isolats de S. pyogenes invasif qui ont été prélevés en 2020 sont inclus dans cet article, ce qui représente une diminution par rapport à 2019 (n = 3194). Les types emm les plus fréquents en 2020 étaient emm49 (16,8 %, n = 483) et emm76 (15,0 %, n = 429), tous deux augmentant leur prévalence de façon importante depuis 2016 (p < 0,001). L’ancien type le plus répandu, le gène emm1, est passé de 15,4 % (n = 325) en 2016 à 7,6 % (n = 217) en 2020. Les taux de résistance aux antimicrobiens en 2020 comprenaient 11,5 % de résistance à l’érythromycine, 3,2 % de résistance à la clindamycine et 1,6 % de non-susceptibilité au chloramphénicol. Conclusion : Bien que le nombre d’isolats de S. pyogenes invasif prélevés ait légèrement diminué en 2020 par rapport aux années précédentes, l’IISGA reste un problème de santé publique important. La distribution des gènes emm au Canada s’est subtilement modifiée au cours des cinq dernières années, s’éloignant du gène emm1, commun et bien connu, pour se rapprocher des gènes emm49 et emm76. Il est important de poursuivre la surveillance des S. pyogenes au Canada afin de suivre l’expansion des types emm de remplacement, ainsi que les clones d’éclosion et la résistance aux antimicrobiens.
dc.description.abstract-fosrctranslation - en: Background: Invasive group A streptococcal (iGAS) disease (caused by Streptococcus pyogenes) has been a nationally notifiable disease in Canada since 2000. This report summarizes the demographics, emm types and antimicrobial resistance of iGAS infections in Canada in 2020. Methods: The Public Health Agency of Canada’s National Microbiology Laboratory (Winnipeg, Manitoba) collaborates with provincial and territorial public health laboratories to conduct national surveillance of invasive S. pyogenes. Emm typing was performed on all isolates using the Centers for Disease Control and Prevention emm sequencing protocol. Antimicrobial susceptibilities were determined using Kirby-Bauer disk diffusion according to Clinical and Laboratory Standards Institute guidelines. Population-based iGAS disease incidence rates up to 2019 were obtained through the Canadian Notifiable Disease Surveillance System. Results: Overall, the incidence of iGAS disease in Canada has increased from 4.0 to 8.1 cases per 100,000 population from 2009 to 2019. The 2019 incidence represents a slight decrease from the 2018 rate of 8.6 cases per 100,000 population. A total of 2,867 invasive S. pyogenes isolates that were collected during 2020 are included in this report, representing a decrease from 2019 (n=3,194). The most common emm types in 2020 were emm49 (16.8%, n=483) and emm76 (15.0%, n=429), both increasing significantly in prevalence since 2016 (p<0.001). The former most prevalent type, emm1, decreased to 7.6% (n=217) in 2020 from 15.4% (n=325) in 2016. Antimicrobial resistance rates in 2020 included 11.5% resistance to erythromycin, 3.2% resistance to clindamycin and 1.6% nonsusceptibility to chloramphenicol. Conclusion: Though the number of collected invasive S. pyogenes isolates decreased slightly in 2020 in comparison to previous years, iGAS disease remains an important public health concern. The emm distribution in Canada has been subtly shifting over the past five years, away from common and well-known emm1 and towards emm49 and emm76. It is important to continue surveillance of S. pyogenes in Canada to monitor expanding replacement emm types, as well as outbreak clones and antimicrobial resistance.
dc.identifier.citation: Golden AR, Griffith A, Demczuk WHB, Tyrrell GJ, Kus JV, McGeer A, Domingo M-C, Hoang L, Minion J, Van Caeseele P, Smadi H, Haldane D, Zahariadis G, Mead K, Steven L, Strudwick L, Li AY, Mulvey MR, Martin I. Surveillance des maladies invasives à streptocoques du groupe A au Canada, 2020. Relevé des infections transmissibles au Canada 2022;48(9):450–8. https://doi.org/10.14745/ccdr.v48i09a05f
dc.identifier.doi: https://doi.org/10.14745/ccdr.v48i09a05f
dc.identifier.issn: 1719-3109
dc.identifier.uri: https://open-science.canada.ca/handle/123456789/615
dc.language.iso: fr
dc.publisher: Agence de la santé publique du Canada
dc.relation.istranslationof: https://doi.org/10.14745/ccdr.v48i09a05
dc.rights - en: Creative Commons Attribution 4.0 International (CC BY 4.0)
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dc.rights.openaccesslevel - en: Green
dc.rights.openaccesslevel - fr: Vert
dc.rights.uri - en: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.rights.uri - fr: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.fr
dc.subject - en: Health
dc.subject - fr: Santé
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dc.title - en: Surveillance des infections invasives à streptocoques du groupe A au Canada, 2020
dc.type - en: Article
dc.type - fr: Article
local.article.journalissue: 9
local.article.journaltitle: Relevé des maladies transmissibles au Canada (RMTC)
local.article.journalvolume: 48
local.pagination: 450-458
local.peerreview - en: Yes
local.peerreview - fr: Oui

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