Invasive pneumococcal disease surveillance in Canada, 2020

Golden, Alyssa; Griffith, Averil; Demczuk, Walter; Lefebvre, Brigitte; McGeer, Allison; Tyrrell, Gregory; Zhanel, George; Kus, Julianne; Hoang, Linda; Minion, Jessica; Van Caeseele, Paul; Smadi, Hanan; Haldane, David; Zahariadis, George; Mead, Kristen; Steven, Laura; Strudwick, Lori; Li, Anita; Mulvey, Michael; Martin, Irene

doi:https://open-science.canada.ca/handle/123456789/622

Invasive pneumococcal disease surveillance in Canada, 2020

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creativework.keywords - en: invasive pneumococcal disease; IPD; Streptococcus pneumoniae; PCV13; pneumococcus; serotype; surveillance; antimicrobial resistance
dc.contributor.author: Golden, Alyssa; Griffith, Averil; Demczuk, Walter; Lefebvre, Brigitte; McGeer, Allison; Tyrrell, Gregory; Zhanel, George; Kus, Julianne; Hoang, Linda; Minion, Jessica; Van Caeseele, Paul; Smadi, Hanan; Haldane, David; Zahariadis, George; Mead, Kristen; Steven, Laura; Strudwick, Lori; Li, Anita; Mulvey, Michael; Martin, Irene
dc.date.accessioned: 2023-06-08T17:50:27Z
dc.date.available: 2023-06-08T17:50:27Z
dc.date.issued: 2022-09
dc.description.abstract - en: Background: Invasive pneumococcal disease (IPD), which is caused by Streptococcus pneumoniae, has been a nationally notifiable disease in Canada since 2000. The use of conjugate vaccines has markedly decreased the incidence of IPD in Canada; however, the distribution of serotypes has shifted in favour of non-vaccine types. This report summarizes the demographics, serotypes and antimicrobial resistance of IPD infections in Canada in 2020. Methods: The Public Health Agency of Canada’s National Microbiology Laboratory (Winnipeg, Manitoba) collaborates with provincial and territorial public health laboratories to conduct national surveillance of IPD. A total of 2,108 IPD isolates were reported in 2020. Serotyping was performed by Quellung reaction and antimicrobial susceptibilities were determined in collaboration with the University of Manitoba/Canadian Antimicrobial Resistance Alliance. Population-based IPD incidence rates were obtained through the Canadian Notifiable Disease Surveillance System. Results: Overall incidence of IPD in Canada decreased significantly from 11.5 (95% confidence interval [CI]: 10.1–13.1) to 6.0 (95% CI: 5.0–7.2), and from 10.0 (95% CI: 9.7–10.3) to 5.9 (95% CI: 5.7–6.2) cases per 100,000 from 2019 to 2020; in those younger than five years and those five years and older, respectively. The most common serotypes overall were 4 (11.2%, n=237), 3 (10.9%, n=229) and 8 (7.2%, n=151). From 2016 to 2020, serotypes with increasing trends (p<0.05) included 4 (6.4%−11.2%), 3 (9.5%−10.9%), 8 (5.2%−7.2%) and 12F (3.6%−5.7%). The overall prevalence of PCV13 serotypes increased over the same period (30.3%−34.9%, p<0.05). Antimicrobial resistance rates in 2020 included 23.0% clarithromycin and 9.9% penicillin (IV meningitis breakpoints). Multidrug-resistant IPD has significantly increased since 2016 (4.2%–9.5%, p<0.05). Conclusion: Though the incidence of IPD decreased in 2020 in comparison to previous years across all age groups, disease due to PCV13 serotypes 3 and 4, as well as non-PCV13 serotypes such as 8 and 12F, increased in prevalence. Continued surveillance of IPD is imperative to monitor shifts in serotype distribution and antimicrobial resistance.
dc.description.abstract-fosrctranslation - fr: Contexte : Les pneumococcies invasives (PI), qui sont causées par Streptococcus pneumoniae, sont des maladies à déclaration obligatoire au Canada depuis 2000. L’utilisation de vaccins conjugués a permis de réduire considérablement l’incidence des PI au Canada; toutefois, la répartition des sérotypes a évolué en faveur des types non vaccinaux. Le présent rapport résume les données démographiques, les sérotypes et la résistance aux antimicrobiens des PI au Canada en 2020. Méthodes : Le Laboratoire national de microbiologie de l’Agence de la santé publique du Canada (Winnipeg, Manitoba) collabore avec les laboratoires de santé publique provinciaux et territoriaux pour assurer la surveillance nationale des PI. Au total, 2108 isolats de PI ont été signalés en 2020. Le sérotypage a été effectué en utilisant la réaction de Quellung et les sensibilités aux antimicrobiens ont été déterminées en collaboration avec l’Université du Manitoba/Alliance canadienne de la résistance aux antimicrobiens (Canadian Antimicrobial Resistance Alliance). Les taux d’incidence des PI fondés sur la population ont été obtenus au moyen du Système canadien de surveillance des maladies à déclaration obligatoire. Résultats : L’incidence globale des PI au Canada a diminué de façon significative, passant de 11,5 (intervalle de confiance [IC] de 95 % : 10,1–13,1) à 6,0 (IC à 95 % : 5,0–7,2), et de 10,0 (IC à 95 % : 9,7–10,3) à 5,9 (IC à 95 % : 5,7–6,2) cas pour 100000 habitants de 2019 à 2020; chez les moins de cinq ans et chez les cinq ans et plus, respectivement. Les sérotypes les plus fréquents dans l’ensemble étaient 4 (11,2 %, n = 237), 3 (10,9 %, n = 229) et 8 (7,2 %, n = 151). De 2016 à 2020, les sérotypes présentant des tendances à la hausse (p < 0,05) comprenaient 4 (6,4 %–11,2 %), 3 (9,5 %–10,9 %), 8 (5,2 %–7,2 %) et 12F (3,6 %–5,7 %). La prévalence globale des sérotypes PCV13 a augmenté au cours de la même période (30,3 %–34,9 %, p < 0,05). Les taux de résistance aux antimicrobiens en 2020 comprenaient 23,0 % à la clarithromycine et 9,9 % à la pénicilline (valeurs critiques définies pour le traitement IV de la méningite). Les PI multirésistantes aux médicaments ont significativement augmenté depuis 2016 (4,2 %–9,5 %, p < 0,05). Conclusion : Bien que l’incidence des PI ait diminué en 2020 par rapport aux années précédentes dans tous les groupes d’âge, la prévalence des maladies dues aux sérotypes 3 et 4 du PCV13, ainsi qu’aux sérotypes non PCV13 tels que le 8 et le 12F, a augmenté. Il est impératif de poursuivre la surveillance des PI pour suivre l’évolution de la distribution des sérotypes et de la résistance aux antimicrobiens.
dc.identifier.citation: Golden AR, Griffith A, Demczuk WHB, Lefebvre B, McGeer A, Tyrrell GJ, Zhanel GG, Kus JV, Hoang L, Minion J, Van Caeseele P, Smadi H, Haldane D, Zahariadis G, Mead K, Steven L, Strudwick L, Li AY, Mulvey MR, Martin I. Invasive pneumococcal disease surveillance in Canada, 2020. Can Commun Dis Rep 2022;48(9):396–406. https://doi.org/10.14745/ccdr.v48i09a04
dc.identifier.doi: https://doi.org/10.14745/ccdr.v48i09a04
dc.identifier.issn: 1481-8531
dc.identifier.uri: https://open-science.canada.ca/handle/123456789/622
dc.language.iso: en
dc.publisher: Public Health Agency of Canada
dc.relation.istranslationof: 10.14745/ccdr.v48i09a04f
dc.rights - en: Creative Commons Attribution 4.0 International (CC BY 4.0)
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dc.rights.openaccesslevel - en: Green
dc.rights.openaccesslevel - fr: Vert
dc.rights.uri - en: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.rights.uri - fr: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.fr
dc.subject - en: Health
dc.subject - fr: Santé
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dc.title - en: Invasive pneumococcal disease surveillance in Canada, 2020
dc.type - en: Article
dc.type - fr: Article
local.article.journalissue: 9
local.article.journaltitle: Canada Communicable Disease Report
local.article.journalvolume: 48
local.pagination: 396-406
local.peerreview - en: Yes
local.peerreview - fr: Oui

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