Lake Utopia Rainbow Smelt, large-bodied population (LURS-LbP) : updated population abundance and genetic analyses

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dc.contributor.author

Canadian Science Advisory Secretariat

Canada. Department of Fisheries and Oceans. Maritimes Region

dc.date.accessioned

2024-09-13T10:39:51Z

dc.date.available

2024-09-13T10:39:51Z

dc.date.issued

2024

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Lake Utopia is part of the Magaguadavic River watershed in southwestern New Brunswick. The Rainbow Smelt (Osmerus mordax) living in Lake Utopia (LURS) represent one of the only three confirmed occurrences in Canada of co-existing genetically divergent smelt populations. Two populations of smelt co-exist in the lake: the small-bodied population (SbP) and the large-bodied population (LbP). The SbP has been protected under the Species at Risk Act (SARA) since 2003. The LbP was designated as Threatened by the Committee on the Status of Endangered Wildlife in Canada (COSEWIC 2008) because it is one of a sympatric species pair, it is endemic to a single lake with a small index of area of occupancy (6 km2), it spawns in only three small streams, and it could quickly become extinct through degradation of spawning streams from increasing development around the lake shore and impacts of the dip-net fishery. Potential threats identified by COSEWIC (2008) were the introduction of exotic species and increasing eutrophication. Fisheries and Oceans Canada (DFO) undertook a Recovery Potential Assessment (RPA) for both LbP and SbP populations in 2010 (DFO 2011). Both populations were re-assessed as endangered by COSEWIC in 2018. The LbP was listed as endangered under SARA in 2019. Sampling of the 2014 and 2017 LbP spawning runs were used to estimate population abundance and provide advice on an appropriate population size objective, as well as the likelihood that the population objective could be achieved under current levels of mortality (DFO 2018). However, the abundance estimates for the 2014 and 2017 spawning runs were uncertain as genetic analyses of the 2014 spawning run indicated a mismatch between expected genotype and the minimum fork length used to differentiate LbP from SbP spawners. No genetic analyses were available for the 2017 spawning run. Recent genetic analyses of the 2017 LbP spawning run, as well as tissue sampling of SbP spawners in 2017 and 2018, provide an opportunity to review the minimum fork length that can be used to differentiate phenotypically between the LbP and SbP populations. The objectives of this Science Response Process were to: Provide updated abundance estimates for LURS-LbP in 2014 and 2017 based on genetic analysis of these samples undertaken in 2019. Review the recommended minimum fork length criterion for distinguishing LURS-LbP from LURS-SbP. Discuss how the genetic analyses and updated abundance estimates affect the likelihood that the updated abundance objective for LURS-LbP can be achieved under current levels of mortality (actual mortality levels are not known). This Science Response Report results from the Regional Science Response Process of November 19, 2019, and January 20, 2020, on Lake Utopia Rainbow Smelt, Large-bodied Population (LURS-LbP) Population Abundance and Allowable Harm Estimate.

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Le lac Utopia fait partie du bassin versant de la rivière Magaguadavic, dans le sud-ouest du Nouveau-Brunswick. L’éperlan arc-en-ciel du lac Utopia (Osmerus mordax) représente l’un des trois seuls cas confirmés de coexistence de populations d’éperlans génétiquement distinctes au Canada. Deux populations d’éperlans coexistent dans le lac Utopia, une population d’individus de petite taille et une population d’individus de grande taille. La population d’individus de petite taille est protégée en vertu de la Loi sur les espèces en péril (LEP) depuis 2003. Le Comité sur la situation des espèces en péril au Canada (COSEPAC 2008) a évalué la population d’individus de grande taille et l’a désignée « menacée », car elle fait partie d’une paire sympatrique, elle est endémique à un seul lac dont l’indice de zone d’occupation est petit (6 km2), elle ne fraye que dans trois petits ruisseaux et elle pourrait rapidement disparaître à la suite d’une dégradation des ruisseaux de fraie en raison d’une augmentation du développement sur les rives du lac et des impacts de la pêche à l’épuisette. Les menaces possibles cernées par le COSEPAC (2008) étaient l’introduction d’espèces exotiques et l’eutrophisation accrue. Pêches et Océans Canada (MPO) a réalisé une évaluation du potentiel de rétablissement (EPR) pour les populations d’éperlans arc-en-ciel de grande taille et de petite taille en 2010 (MPO 2011). Le COSEPAC a réévalué ces deux populations et les a désignées « en voie de disparition » en 2018. La population d’individus de petite taille a été inscrite sur la liste des espèces en voie de disparition de la LEP en 2019. On a échantillonné les remontes d’individus de petite taille de 2014 et de 2017 pour estimer l’abondance de la population et produire un avis sur un objectif approprié selon la taille de la population, ainsi que sur la probabilité que cet objectif puisse être atteint compte tenu des niveaux de mortalité actuels (MPO 2018). Cependant, les estimations de l’abondance pour les remontes de 2014 et de 2017 étaient incertaines, car les analyses génétiques de 2014 indiquaient un manque de concordance entre le génotype prévu et la longueur à la fourche minimale utilisée pour différencier les reproducteurs de la population d’individus de petite taille de ceux de la population d’individus de grande taille. Aucune analyse génétique n’était disponible pour la remonte de 2017. Les analyses génétiques récentes de la remonte d’individus de grande taille de 2017, ainsi que l’échantillonnage des tissus des reproducteurs de petite taille en 2017 et en 2018, offrent l’occasion de revoir la longueur à la fourche minimale qui peut être utilisée pour différencier les deux populations sur le plan des phénotypes. Voici les objectifs du présent processus de réponse des Sciences. Fournir une estimation actualisée de l’abondance de la population d’éperlans arc-en-ciel de grande taille du lac Utopia d’après les échantillonnages réalisés en 2014 et 2017 et l’analyse génétique entreprise en 2019 sur ces échantillons. Passer en revue le critère de longueur à la fourche minimale recommandé pour distinguer la population d’éperlans arc-en-ciel de grande taille du lac Utopia de la population d’éperlans arc-en-ciel de petite taille du lac Utopia. Discuter de l’influence des analyses génétiques et des estimations actualisées de l’abondance sur la probabilité d’atteindre l’objectif d’abondance mis à jour pour la population d’éperlans arc-en-ciel de grande taille du lac Utopia, compte tenu des niveaux de mortalité actuels (les niveaux de mortalité réels ne sont pas connus). La présente réponse des Sciences découle du processus régional de réponse des Sciences du 19 novembre 2019 et le 20 janvier 2020 qui portait sur la population d’éperlans arc-en-ciel de grande taille du lac Utopia – Estimation de l’abondance et des dommages admissibles.

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DFO. 2024. Lake Utopia Rainbow Smelt, Large-bodied Population (LURS-LbP): Updated Population Abundance and Genetic Analyses. DFO Can. Sci. Advis. Sec. Sci. Resp. 2024/031.

dc.identifier.govdoc

Fs70-7/2024-031E-PDF

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9780660725437

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1919-3769

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https://waves-vagues.dfo-mpo.gc.ca/library-bibliotheque/41256128.pdf

https://open-science.canada.ca/handle/123456789/2935

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en

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Center for Science Advice (CSA), Maritimes Region, Fisheries and Oceans Canada, Bedford Institute of Oceanography

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https://open-science.canada.ca/handle/123456789/2936

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Biological diversity

Nature and environment

Water

dc.subject - fr

Diversité biologique

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dc.title - en

Lake Utopia Rainbow Smelt, large-bodied population (LURS-LbP) : updated population abundance and genetic analyses

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Science Response : updated LURS abundance and genetic analyses

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2024/031

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