Genetic Risks Associated with Sablefish Aquaculture in British Columbia, Canada

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dc.contributor.author

Canadian Science Advisory Secretariat

Canada. Department of Fisheries and Oceans. Pacific Region

dc.date.accessioned

2025-06-11T13:15:05Z

dc.date.available

2025-06-11T13:15:05Z

dc.date.issued

2025

dc.description.abstract - en

Sablefish (Anoplopoma fimbria) aquaculture is currently limited to three marine facilities in British Columbia (BC) with six-year licences that were issued on July 1st, 2024. As for any cultured species, removal of wild Sablefish individuals from a population for broodstock and inadvertent release of aquaculture individuals back into a population have the potential to pose genetic risks to the long-term sustainability of the species. For instance, captive and wild fish may be genetically or epigenetically differentiated, such that gene flow from captive-bred or captive-reared populations into natural populations may adversely affect fitness in the wild. The magnitudes of these potential genetic risks are often context- and species-specific, and genetic risks have yet to be formally evaluated for Sablefish aquaculture in BC. Understanding the genetic risks associated with marine Sablefish aquaculture is an important precursor to the continuation of this practice in a scientifically defensible manner within the province. Current aquaculture activities for Sablefish in BC involve collecting wild-sourced individuals for broodstock and producing either first- or second-generation captive-reared offspring with no intentional release of captive individuals back into the wild. In captive environments, natural selection that is typically experienced in the wild is relaxed, and artificial or domestication selection may cause traits to shift in a manner that would be sub-optimal in the natural environment. As a result, these differences can be harmful to wild populations if inadvertent escapees introduce disadvantageous genetic variation into natural habitats. The size of the genetic risks associated with the collection of broodstock and domestication are dependent on both the specific aquaculture practices and the biology of the cultured species. Numerous studies have demonstrated that gene flow from captive to wild populations is often to the detriment of fitness in the wild. However, the majority of this work in finfish has focused on salmonids, particularly Atlantic Salmon (Salmo salar), which have populations that are highly genetically structured. Unlike salmonids, Sablefish populations are widespread and relatively unstructured, suggesting that the genetic risks associated with aquaculture of this species may be comparatively low. In 2022, the stock status for Sablefish in BC, was found to be in the healthy zone (DFO 2009; DFO 2023). Fisheries and Oceans Canada (DFO) Aquaculture Management Division has requested that Science Branch provide advice on the genetic risks associated with marine aquaculture of Sablefish under both current practices and a possible future scenario in which broodstock are no longer wild-sourced. The assessment and advice arising from this Canadian Science Advisory Secretariat (CSAS) Science Response (SR) process will be used to support future decision-making related to Sablefish aquaculture. The specific objectives of this review are to: 1. Review the current understanding of wild Sablefish population genetics in British Columbia. 2. Document the potential genetic risks posed to wild Sablefish due to captive-rearing of individuals for aquaculture harvest. 3. Evaluate these potential genetic risks to wild populations in the context of current Sablefish aquaculture practices in British Columbia. 4. Assess how genetic risks may change if current practices for Sablefish aquaculture transition from the use of wild-sourced broodstock to captive broodstock. The intent of this report is not to provide a risk assessment of Sablefish aquaculture. Instead, this report serves to summarize the current understanding of Sablefish genetics and population structure in British Columbia, to identify the direct genetic risks of aquaculture activities to wild populations of the species, and to compare those genetic risks to those associated with the culture of other finfish species (e.g., Atlantic salmon). Finally, this report highlights data deficiencies that limit the certainty to which genetic risks of aquaculture can be assessed for this species. This Science Response Report results from the regional peer review of October 30, 2024, on the Genetic Risks to Wild Sablefish from the Escape of Farmed Sablefish.

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La pisciculture de la morue charbonnière (Anoplopoma fimbria) est actuellement limitée à trois installations marines en Colombie-Britannique (C.-B.) qui ont chacune reçu un permis de six ans délivré le 1er juillet 2024. Comme pour toutes les espèces d’élevage, le prélèvement de morues charbonnières sauvages dans une population pour constituer un stock de géniteurs et le rejet par inadvertance d’individus issus de l’élevage dans une population peuvent présenter des risques génétiques pour la viabilité à long terme de l’espèce. Par exemple, les poissons en captivité et sauvages peuvent être génétiquement ou épigénétiquement différents, de sorte que le flux génétique des populations reproduites ou élevées en captivité vers les populations naturelles peut avoir un effet négatif sur la valeur adaptative dans la nature. L’ampleur de ces risques génétiques potentiels dépend souvent du contexte et de l’espèce, et les risques génétiques n’ont pas encore été officiellement évalués pour la pisciculture de la morue charbonnière en Colombie-Britannique. La compréhension des risques génétiques associés à la pisciculture marine de la morue charbonnière est un facteur important de la poursuite de cette pratique d’une manière défendable sur le plan scientifique dans la province. Actuellement, les activités de pisciculture de la morue charbonnière en Colombie-Britannique consistent à prélever des individus d’origine sauvage pour le stock de géniteurs et à produire des descendants de première ou de deuxième génération élevés en captivité, sans relâcher intentionnellement des individus en captivité dans la nature. La sélection naturelle qui s’exerce généralement dans la nature est réduite en captivité, et la sélection artificielle ou de domestication peut entraîner une évolution des caractères qui serait sous-optimale dans le milieu naturel. De ce fait, ces différences peuvent être néfastes pour les populations sauvages si des individus évadés par inadvertance introduisent des variations génétiques désavantageuses dans les habitats naturels. L’ampleur des risques génétiques associés au prélèvement de stocks de géniteurs et à la domestication dépend à la fois des pratiques piscicoles particulières et de la biologie de l’espèce d’élevage. De nombreuses études ont démontré que le flux génétique des populations en captivité vers les populations sauvages se fait souvent au détriment de la valeur adaptative dans la nature. Toutefois, la majorité de ces travaux sur les poissons se sont concentrés sur les salmonidés, en particulier le saumon atlantique (Salmo salar), dont les populations sont fortement structurées sur le plan génétique. Contrairement aux salmonidés, les populations de morues charbonnières sont bien répandues et relativement peu structurées, ce qui laisse supposer que les risques génétiques associés à la pisciculture de cette espèce pourraient être relativement faibles. En 2022, l’état du stock de morue charbonnière en Colombie-Britannique se situait dans la zone saine (MPO 2009; MPO 2023). La division de la Gestion de l’aquaculture de Pêches et Océans Canada (MPO) a demandé à la direction des Sciences de fournir un avis sur les risques génétiques associés à la pisciculture marine de la morue charbonnière avec les pratiques actuelles et avec un éventuel scénario dans lequel les stocks de géniteurs ne seraient plus d’origine sauvage. L’évaluation et l’avis découlant de ce processus de réponse des Sciences du Secrétariat canadien des avis scientifiques (SCAS) serviront à appuyer les prochaines prises de décision relatives à la pisciculture de la morue charbonnière. Les objectifs précis de cet examen sont les suivants : 1. Examiner les connaissances actuelles sur la génétique des populations sauvages de morues charbonnières en Colombie-Britannique. 2. Documenter les risques génétiques pour la morue charbonnière sauvage causés par l’élevage en captivité d’individus destinés à la récolte. 3. Évaluer ces risques génétiques pour les populations sauvages compte tenu des pratiques actuelles de pisciculture de la morue charbonnière en Colombie-Britannique. 4. Évaluer la façon dont les risques génétiques pourraient changer si les pratiques actuelles de pisciculture de la morue charbonnière passaient de l’utilisation de stocks de géniteurs sauvages à des stocks de géniteurs en captivité. Le présent rapport ne cherche pas à fournir une évaluation des risques liés à la pisciculture de la morue charbonnière. Il sert plutôt à résumer la compréhension actuelle de la génétique et de la structure des populations de morues charbonnières en Colombie-Britannique, à déterminer les risques génétiques directs des activités piscicoles pour les populations sauvages de l’espèce et à comparer ces risques génétiques à ceux associés à l’élevage d’autres espèces de poissons (p. ex. le saumon atlantique). Enfin, le présent rapport met en évidence des lacunes dans les données qui limitent la certitude de l’évaluation des risques génétiques de la pisciculture pour cette espèce. La présente réponse des Sciences découle de l’examen par les pairs régional du 30 octobre 2024 sur les Risques génétiques associés à l’aquaculture de la morue charbonnière en Colombie-Britannique, au Canada.

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DFO. 2025. Genetic Risks Associated with Sablefish Aquaculture in British Columbia, Canada. DFO Can. Sci. Advis. Sec. Sci. Resp. 2025/014.

dc.identifier.govdoc

Fs70-7/2025-014E-PDF

dc.identifier.isbn

9780660768311

dc.identifier.issn

1919-3769

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https://waves-vagues.dfo-mpo.gc.ca/library-bibliotheque/41291335.pdf

https://open-science.canada.ca/handle/123456789/3714

dc.language.iso

en

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Centre for Science Advice (CSA), Pacific Region, Fisheries and Oceans Canada

dc.publisher - fr

Centre des avis scientifiques (CAS), Région du Pacifique, Pêches et Océans Canada

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https://open-science.canada.ca/handle/123456789/3715

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Aquaculture

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Genetic Risks Associated with Sablefish Aquaculture in British Columbia, Canada

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Genetic Risks of Sablefish Aquaculture

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Report

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Rapport

local.pagination

22 pages

local.report.reportnum

2025/014

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Science Response (Canadian Science Advisory Secretariat)

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Réponse des Sciences (Secrétariat canadien des avis scientifiques)

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