An overview of the Critical Appraisal Tool (CAT) process and the peer-review of a protocol for a systematic map to address “What are the effects of Sea Lice from Net-Pen Salmon farms on wild Pacific Salmon in British Columbia?”– Phase 1

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dc.contributor.author
Fisheries and Oceans Canada
Pêches et Océans Canada
dc.date.accessioned
2025-07-23T16:13:21Z
dc.date.available
2025-07-23T16:13:21Z
dc.date.issued
2025
dc.description.abstract - en
Sea lice have been linked to effects on wild salmon. However, there remains uncertainty about the contribution of salmon farms to those effects. The current peer review process reviewed a protocol to develop a systematic map that will be used to address the primary question, “What are the effects of sea lice from net-pen salmon farms on wild Pacific salmon in British Columbia?” A systematic map is an approach that systematically and transparently collects and describes the abundance and distribution of research effort (i.e., research papers and grey literature), and identifies groups of information (evidence clusters) and knowledge gaps. An evidence cluster is a group of studies or cases investigating a similar topic within the broader primary question. The overarching process consists of three phases, culminating in a systematic review(s). The development of a systematic map in Phase I involves searching specialist websites and databases using relevant, pre-defined, and specific search terms. The retrieved records are then screened using pre-defined eligibility criteria for inclusion in ongoing analysis. This process ensures transparency, repeatability, and rigour. The systematic map will provide a collated broad summary of the existing scientific information to assess the effects of sea lice belonging to the genera Lepeophtheirus and Caligus on five species of Pacific salmon (Chinook, coho, chum, sockeye, and pink). The systematic map will include lice on wild, enhanced, and farmed Pacific and Atlantic salmon globally to ensure that the most relevant studies are available in determining evidence clusters for the systematic review(s). Once the systematic map is assembled, areas where sufficient evidence exists (evidence clusters) to enable systematic review(s) will be identified. As part of the subsequent systematic review(s), the prioritized evidence clusters will be critically appraised to assess the bias and potential ability of each piece of information to address the primary question. For the systematic map, species of salmon and sea lice will initially be considered separately. Ideally, an evidence cluster will be defined as a group of at least twenty-five similar cases but could be as low as three. If few evidence clusters emerge with more than three cases, species will be grouped. At a minimum, cases will be divided by Pacific and Atlantic salmon, and the sea lice genera of Lepeophtheirus and Caligus. This scientific peer review process provided peer review of the systematic map protocol, and set out directions for the next two phases to address the primary question including: 1. Searching for information on farmed and wild Pacific and Atlantic salmon globally. 2. Searching all species of the sea louse genera, Lepeophtheirus and Caligus. 3. Considering the inclusion of studies beyond the languages of English and French. 4. Guidance on what will constitute an evidence cluster in the subsequent systematic review.
dc.description.abstract-fosrctranslation - fr
Le pou du poisson a été lié à des effets sur le saumon sauvage. Cependant, il subsiste une incertitude quant à la contribution des élevages de saumons à ces effets. Le processus d’examen par les pairs a examiné un protocole visant à élaborer une carte systématique qui sera utilisée pour répondre à la question principale suivante : « Quels sont les effets du pou du poisson provenant des élevages de saumons en parcs à filet sur le saumon sauvage du Pacifique en Colombie-Britannique? » Une carte systématique est une approche qui permet de recueillir et de décrire systématiquement et de manière transparente les nombreuses activités de recherche et leur répartition (p. ex. les documents de recherche et la littérature grise) et de déterminer les groupes de renseignements (groupes de données probantes) et les lacunes dans les connaissances. Un groupe de données probantes est un groupe d’études ou de cas portant sur un sujet similaire dans le cadre d’une question principale plus vaste. Le processus global comprend trois phases, qui culminent en un examen systématique. L’élaboration d’une carte systématique au cours de la phase I comprend des recherches dans les sites Web et les bases de données spécialisés en utilisant des termes de recherche pertinents, prédéfinis et précis. Les dossiers récupérés sont ensuite examinés à l’aide de critères d’admissibilité prédéfinis aux fins d’inclusion dans l’analyse continue. Ce processus assure la transparence, la répétabilité et la rigueur. La carte systématique fournira un résumé général colligé des données scientifiques existantes pour évaluer les effets du pou du poison appartenant aux genres Lepeophtheirus et Caligus sur cinq espèces de saumon du Pacifique (saumon chinook, saumon coho, les poux sur les saumons du Pacifique et atlantique sauvages, mis en valeur et d’élevage afin de s’assurer que les études les plus pertinentes sont disponibles pour déterminer les groupes de données probantes aux fins des examens systématiques. Une fois la carte systématique établie, on déterminera les domaines pour lesquelles il existe suffisamment de données probantes (groupes de données probantes) pour permettre un examen systématique. Dans le cadre de ces examens systématiques, les groupes de données probantes prioritaires seront évalués de manière critique afin d’évaluer le biais et la capacité potentielle de chaque donnée à répondre à la question principale. Pour la carte systématique, les espèces de saumons et de poux du poisson seront d’abord examinées séparément. Idéalement, un groupe de données probantes sera défini comme un groupe d’au moins vingt-cinq cas similaires, mais il pourrait n’en comprendre que trois. Si l’on ne peut déterminer que peu de groupes de données probantes comprenant plus de trois cas, les espèces seront regroupées. Au minimum, les cas seront divisés entre saumon du Pacifique, saumon atlantique et genres de pou du poisson Lepeophtheirus et Caligus. Ce processus scientifique d’examen par les pairs a permis un examen du protocole de cartographie systématique et a défini des orientations pour les deux phases suivantes afin de répondre à la question principale, notamment : 1. Rechercher des renseignements sur les saumons atlantique et du Pacifique d’élevage et sauvages à l’échelle mondiale. 2. Effectuer des recherches sur toutes les espèces des genres de pou du poisson Lepeophtheirus et Caligus. 3. Envisager l’inclusion d’études rédigées dans des langues autres que l’anglais et le français. 4. Donner des orientations sur ce qui constituera un groupe de données probantes dans les examens systématiques.
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dc.identifier.citation
DFO. 2025. An Overview of the Critical Appraisal Tool (CAT) Process and the Peer-Review of a Protocol for a Systematic Map to Address “What are the Effects of Sea Lice from Net-Pen Salmon Farms on Wild Pacific Salmon in British Columbia?”– Phase 1. DFO Can. Sci. Advis. Sec. Sci. Advis. Rep. 2025/028.
dc.identifier.govdoc
Fs70-6/2025-028E-PDF
dc.identifier.isbn
9780660775661
dc.identifier.issn
1919-5087
dc.identifier.uri
https://waves-vagues.dfo-mpo.gc.ca/library-bibliotheque/4129483x.pdf
https://open-science.canada.ca/handle/123456789/3822
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Center for Science Advice (CSA), National Capital Region, Fisheries and Oceans Canada
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Centre des avis scientifiques (CAS), Région de la capitale nationale
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https://open-science.canada.ca/handle/123456789/3823
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Maps
Parasites
Aquaculture
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An overview of the Critical Appraisal Tool (CAT) process and the peer-review of a protocol for a systematic map to address “What are the effects of Sea Lice from Net-Pen Salmon farms on wild Pacific Salmon in British Columbia?”– Phase 1
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Overview of the CAT process and the peer review of a protocol for a systematic map to address the effects of Sea Lice
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Report
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Rapport
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2025/028
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Science Advisory Report (Canadian Science Advisory Secretariat)
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